בתי ספר מכילים, כמו במודל שפיתחה עמותת אינקלו, מציעים שילוב יחידני בסביבה יוצאת דופן. בין היתר יש בכל כיתה שני אנשי צוות ו-27 תלמידים, 25% מהתלמידים בבית הספר בעלי צרכים מיוחדים מאובחנים במוגבלות בשכיחות נמוכה, האדריכלות תומכת פדגוגיה, ויש תוכניות אישיות לכל התלמידים.
ההכלה מיושמת בארבע זירות (פדגוגית, חברתית, ארגונית ופיזית-סביבתית) ונועדה לספק מענה כולל לתלמידים, לעובדי ההוראה, לצוות התומך והטיפולי ולהורים.
בית ספר מכיל מאגם את המשאבים של תלמידיו המשולבים הזכאים לסל אישי ומעניק את הסלים ואת המשאבים באופן קבוצתי.